週次 |
日期 |
單元主題 |
第2週 |
9/22 |
次世代定序在分子生物學上的應用簡介與原理
上課地點為 生科館 419電腦教室 |
第3週 |
9/29 |
RNA-seq /ChIP-seq原理與應用工具 |
第4週 |
10/6 |
請演講1-Linux 系統與國網使用--國網中心黃介瑋/賴俊吉 於生科館3A教室上課 |
第5週 |
10/13 |
路資源應用:IGV, UCSC genome browser, David genome |
第6週 |
10/20 |
Unix系統 送job實作練習/SRA files/ Sequence alignment ---(RNA-seq analysis 1) |
第7週 |
10/27 |
邀請演講2--中研分生所 nanopore sequencing analysis
|
第8週 |
11/3 |
HT-seq count/R 工具的應用與實作—DEseq analysis, scatter plots (RNA-seq analysis 2) |
第9週 |
11/10 |
文獻討論1---學生報告NGS應用之技術
第7組: 趙珮安 楊辰萱 周姿吟
第6組: 李思穎 黃紹綺 江尚桓 于庭懿 |
第10週 |
11/17 |
R 工具的應用與實作—heatmap, PCA, GSEA---繳交報告計畫摘要---(RNA-seq analysis 3) |
第11週 |
11/24 |
文獻討論2---學生報告NGS應用之技術
第2組: 潘冠妤 陳政諺 張維展
第5組: 劉義弘 郭亭萱 邵子恩 |
第12週 |
12/1 |
文獻討論3---學生報告NGS應用之技術
第1組: 陳怡如 劉香伶 蔣依恬 毛鈞加
第3組: 徐源成 徐聲祐 林祐楨 黨沛騏
第4組: 粘庭碩 巫宗錡 郭泉浩 |
第13週 |
12/8 |
邀請演講3-pipeline國網中心賴俊吉/黃介瑋 |
第14週 |
12/15 |
個案討論報告與實作
第3組: 徐源成 徐聲祐 林祐楨 黨沛騏
第4組: 粘庭碩 巫宗錡 郭泉浩 |
第15週 |
12/22 |
個案討論報告與實作
第2組: 潘冠妤 陳政諺 張維展
第1組: 陳怡如 劉香伶 蔣依恬 毛鈞加 |
第16週 |
12/29 |
個案討論報告與實作
第7組: 趙珮安 楊辰萱 周姿吟
第6組: 李思穎 黃紹綺 江尚桓 于庭懿 |
第17週 |
1/5 |
個案討論報告與實作
第5組: 郭亭萱 劉義弘 邵子恩 |
第3-1週 |
10/03 |
期末報告摘要範例 |